Charles Aránguiz se unió a Colo Colo el 5 de junio de 2009, marcando el inicio de una etapa importante en su carrera. El princípe, que despires se fue a La U, ya aceptó jugar en Cacique e su debut oficial ocurrió el 27 de junho de 2009 en un amistoso contra el Peñarol de Uruguay. A pesar de un inicio titubeante y algo irregular en el torneo Clausura de 2009, Aránguiz logró consolidarse en el equipo, siendo titular en la mayoría de los partidos y contribuyendo de manera decisiva a la obtención del título.
Durante ese período, Aránguiz formó parte de una alineación destacada que incluía a jugadores como Ezequiel Miralles, Macnelly Torres, José Manuel Rey, Cristian Bogado y Esteban Paredes. Juntos, llevaron a Colo Colo a conquistar el torneo, consolidando la importancia del mediocampista en el esquema del entrenador.
Sin embargo, el año 2010 presentó desafíos para Aránguiz y Colo Colo. El equipo fue eliminado en la fase de grupos de la Copa Libertadores de América, y la salida del entrenador Hugo Tocalli complicó aún más la situación. Con la llegada de Diego Cagna como nuevo director técnico, Aránguiz comenzó a perder protagonismo en el club, lo que marcó un periodo de incertidumbre en su carrera en Colo Colo.
A pesar de estos desafíos, el paso de Charles Aránguiz por Colo Colo es recordado por su contribución clave en el título del Clausura de 2009 y por su rol como pieza fundamental en el mediocampo durante su tiempo en el club. Su trayectoria en Colo Colo representó una etapa importante en su carrera, sentando las bases para futuros éxitos tanto a nivel nacional como internacional.
